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IPKULS Cloud Lab:自动化 VS 手工操作对比

通过统一对比展示自动化平台在实验效率和通量上的显著优势

实验项目 手工操作 自动化操作 效率提升
大肠杆菌载体构建
PCR片段扩增 → 纯化 → 载体转化 → 涂布培养 → PCR验证
24
样本/周
传统单管式操作
2000
样本/周
96孔板式高通量
83倍
大肠杆菌蛋白表达检测
克隆接种 → 扩大培养 → 诱导表达 → 收菌裂解 → 蛋白检测
960
样本/周
10个96孔板/周
5376
样本/周
56个96孔板/周
5.6倍
标签蛋白纯化
菌体裂解 → 上清收集 → 树脂平衡结合 → 洗涤洗脱 → 后处理
72
样本/天
离心柱纯化最高值
480
样本/天
96孔磁珠纯化
6.7倍

智能自动化合成生物技术服务

全面覆盖合成生物学研究流程,提供从基因编辑到蛋白表达的一站式解决方案

基因工程类服务

基因编辑和基因组工程
构建含sgRNA的编辑质粒进行高通量基因缺失、利用CRISPR/Cas9技术对大肠杆菌基因进行高通量重组、插入或替换
CRISPR/Cas9 高通量
基因克隆
从来源DNA(如细菌基因组)按照需求进行高通量的基因克隆,包括提取DNA、基因片段合成与构建体、DNA的鉴定、纯化和定量、DNA组装和转化
>2000样本/周
质粒转化
高通量的将质粒化学转移到大肠杆菌、酵母等宿主细胞
96样本/小时 多宿主

自动化操作类服务

全自动单克隆挑取
高通量的进行菌种平板上单克隆挑取,固体平板上单克隆挑取,自动接种和涂布
2000样本/小时 全自动
纳升级微量移液
精准的超微量移液(2.5nL-5uL)以及高通量的生化检测(如10uLqPCR体系配制与qPCR检测)
2.5nL-5uL 96~384样本/小时
基因回路设计
高通量的构建含目标基因元件的菌株,从基因表达,代谢工程等方面筛选菌株
代谢工程 高通量

蛋白质工程类服务

蛋白质表达
高通量的微量表达蛋白(如大肠杆菌1mL菌液,25℃表达8h)
1344-2688样本/天 微量表达
蛋白质纯化
高通量的纯化微量蛋白质(根据磁珠纯化法纯化的蛋白质合能力µg-mg级别)
µg-mg级别 磁珠纯化
蛋白质定向进化
高通量构建突变体库(如易错PCR,DNA Shuffling和随机饱和方式),并通过多种检测模式筛选菌株
突变体库 多重筛选

检测分析类服务

基因及转录水平分析
通过荧光标记法对转录进行定量性分析,包括高通量qPCR,多重qPCR,蛋白质谱,RNA、核酸样品降解分析等
荧光标记 多重检测
蛋白质水平验证
通过荧光标记法对蛋白质进行定量性分析,如蛋白质定量和定性检测,离子通道分析,荧光转移等
定量检测 多参数
细胞水平分析
使用荧光标记法进行微通量分析细胞及其产物,如细胞活性/细胞毒性检测,细胞信号传递,细胞迁移检测
细胞活性 信号检测
AI for Science Era

构建数智化生命科学研究平台

在AI for Science时代,我们构建全新的科研协作范式,打破传统壁垒,让全球首个AI4S原生闭环生命科学实验室随时随地赋能您的研究

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BIOMA - AI4S原生多智能体系统

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智能协同,让每个研究想法都能无缝转化为科学发现

AI理论科学家
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用自然语言提出研究设想,即刻调动全球顶尖AI预测模型,提供高效、精准的理论设计与预测

AI实验规划师
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基于独家实验协议数据库,通过多轮对话规划实验流程,将奇思妙想绘制成可视化实验蓝图

"黑灯实验室"指挥官
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将复杂实验方案转化为机器语言,精准调度22台自动化设备,实现动态监控与智能预警

AI数据分析师
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提供丰富分析工具与可视化图表,深度挖掘数据洞见,形成"设想→设计→执行→分析→优化"闭环

全链数智闭环 - AI持续学习进化

从"设想→设计→执行→分析→优化"的自主学习闭环,让科学探索不断进化

理论设想
实验设计
自动执行
数据分析
迭代优化
Experiment Cases

智能自动化实验案例展示

展示iPKU Cloud Lab平台的智能自动化实验流程,从基因组装到蛋白表达,涵盖生命科学研究的核心实验技术

基因组装和分子克隆

  • PCR/酶切反应:声波移液系统完成PCR/酶切反应体系构建,封膜机封膜,送至自动PCR仪进行反应
  • 片段回收:撕膜机撕膜,在自动化移液工作站使用磁珠回收片段;声波移液系统完成定量体系构建,并运送至酶标仪完成定量读数
  • 基因组装:声波移液系统完成连接体系构建,封膜机封膜,并运送至PCR仪温控连接
  • 感受态转化培养:自动化移液工作站配合低温模块完成感受态和重组载体混合,封膜机封膜,送至自动PCR仪进行热激反应;自动分液器从试剂槽中加入无抗性培养基,运送至震荡培养箱进行复性培养
  • 涂板,过夜培养:菌液离心,自动化移液工作站去除上清液,加入新的培养基混匀菌体;声波移液系统完成OmniTray板中的涂板操作,运送至震荡培养箱进行静置培养(关闭培养箱的震荡功能)

菌液鉴定和蛋白表达

  • 克隆挑选培养:自动分液器分装培养基,克隆挑选系统完成克隆识别及挑取;运送至震荡培养箱进行培养
  • 菌落PCR检测:声波移液系统完成菌落PCR体系构建,封膜机封膜,运送至自动PCR仪PCR,而后在电泳仪上进行电泳检测
  • 阳性克隆富集冻存:自动化移液工作站将阳性克隆菌体挑取到新的深孔板中富集,加入甘油溶液冻存
  • 蛋白诱导表达:自动化移液工作站实现阳性克隆的再接种(从上一步直接吸取或者甘油菌复苏),运送至震荡培养箱进行培养;自动分液器加入诱导剂诱导表达,运送至震荡培养箱进行培养
  • 细胞裂解:菌液离心收集菌体,自动化移液工作站去除上清,加入裂解液;配合震荡培养箱进行温控裂解;离心,自动化移液工作站吸取上清,转移至新的酶标板中
  • 蛋白检测:自动化移液工作站配合洗板机、震荡培养箱运行ELISA或其他蛋白检测方法;在酶标仪进行读数检测
  • 质粒提取保存:自动化移液工作站配合离心机进行阳性克隆质粒提取和保存

酵母蛋白表达系统

  • 靶基因片段扩增,载体酶切:声波移液系统完成反应体系构建,封膜机封膜,送至自动PCR仪进行反应
  • 回收基因片段,载体,电泳检测;质粒重组:撕膜机撕膜,在自动化移液工作站使用磁珠回收片段,在自动化片段分析仪上进行电泳检测;按照试剂盒要求,由自动化移液工作站配置反应体系,封膜机封膜,送至自动PCR仪进行重组反应
  • 酵母感受态热激转化,培养:自动化移液工作站配合温控模块,将重组质粒与酵母感受态细胞混合,自动PCR仪内进行30℃孵育,自动化移液工作站加入DMSO,在自动PCR仪内42℃孵育;离心,去除上清,加入培养基放入震荡培养箱内培养;离心,去除部分菌液上清,涂板,培养箱内培养
  • 转化子挑选,PCR验证,质粒提取:微生物克隆挑选系统提取阳性单克隆,在声波移液系统上配置菌液PCR体系,在自动PCR仪内进行PCR反应,PCR结果在自动化片段分析仪上检测扩增片段;菌液扩大培养后,在自动化移液工作站工作站上提取质粒,线下测序验证质粒正确性
  • 转化子试表达:自动分液器加入适当培养基放入震荡培养箱内培养;根据时间点取样,离心收集上清液和菌体,验证蛋白以及分析蛋白表达量和最佳收获时间
  • 蛋白提取:自动化移液工作站配合正压模块提取目标蛋白

酵母表面展示

  • 重组质粒、插入片段:50-60ng pETcon3(载体),酶切位点:Ndel、Xhol,100ng 插入片段(eBlocks,IDT)
  • 热激转化,培养:转入S. cerevisiae EBY100 strain(酿酒酵母),EBY 100 菌株在含2% glucose(葡糖糖) 的C-Trp-Ura medium(酵母培养基)生长
  • 诱导表达:将酵母细胞转入含0.2%glucose(葡糖糖) 的SGCCAA medium(酵母培养基),30℃,16-24小时,使用PBSF(含1% BSA)清洗细胞
  • 生物素标记:在室温下用生物素化肽靶标标记40分钟,使用无亲和性标记条件,孵育结束后,使用PBSF清洗细胞并重悬细胞
  • 文库筛选:多功能酶标仪检测筛选细胞

昆虫/动物细胞系统-重组质粒获取

  • 靶基因片段扩增,载体酶切:声波移液系统完成反应体系构建,封膜机封膜,送至自动PCR仪进行反应
  • 回收基因片段,载体,电泳检测;质粒重组:撕膜机撕膜,在自动化移液工作站使用磁珠回收片段,在自动化毛细管电泳仪上进行电泳检测;按照试剂盒要求,由自动化移液工作站配置反应体系,封膜机封膜,送至自动PCR仪进行重组反应
  • Top10感受态热激转化,培养:自动化移液工作站配合温控模块,将重组质粒与感受态细胞混合,在自动PCR仪内进行热激反应,加入正常培养基放入震荡培养箱内培养;离心,去除部分菌液上清,涂板,培养箱内培养
  • 阳性克隆菌液PCR,测序验证,质粒提取:微生物克隆挑选系统提取阳性单克隆,在声波移液系统上配置菌液PCR体系,在自动PCR仪内进行PCR反应,PCR结果在自动化片段分析仪上检测扩增片段;菌液扩大培养后,在自动化移液工作站工作站上提取质粒,线下测序验证质粒正确性
  • DH10Bac 感受态热激转化,培养:自动化移液工作站配合温控模块,将重组质粒与感受态细胞混合,在自动PCR仪内进行热激反应,加入正常培养基放入震荡培养箱内培养;离心,去除部分菌液上清,涂板,培养箱内培养
  • 阳性克隆菌液PCR,测序验证,质粒提取:微生物克隆挑选系统提取阳性单克隆,在声波移液系统上配置菌液PCR体系,在自动PCR仪内进行PCR反应,PCR结果在毛细管电泳仪上检测扩增片段;菌液扩大培养后,在自动化移液工作站工作站上提取质粒,线下测序验证质粒正确性

高通量ELISA实验流程

  • 抗体包被:自动化移液工作站精确分配包被抗体到96/384孔板,确保均匀一致的包被密度
  • 洗板,封闭:自动洗板机执行标准化洗涤程序,自动化移液工作站添加封闭缓冲液,温控孵育
  • 样品/标品稀释和加样孵育:自动化移液工作站完成样品和标准品梯度稀释,精确加样,震荡培养箱温控孵育
  • 洗板,检测抗体孵育:自动洗板机清洗未结合样品,自动化移液工作站添加检测抗体,温控孵育反应
  • 洗板,亲和素HRP孵育:自动洗板机清洗多余抗体,自动化移液工作站添加亲和素-HRP,温控孵育形成检测复合物
  • 加入底物、封闭反应:自动化移液工作站加入显色底物,精确控制反应时间,添加终止液封闭反应
  • 酶标仪读取、分析数据:多功能酶标仪自动读取450nm吸光度,内置软件自动生成标准曲线并计算样品浓度

酶的定向进化自动化流程

  • PCR反应:自动化移液工作站完成PCR反应体系构建,并运送至PCR仪PCR。PCR模板使用质粒DNA
  • DpnI 消化:自动化移液工作站向PCR产物中加入DpnI,送入PCR仪进行DpnI消化,去除甲基化模板质粒
  • 消化产物纯化:Optional:产物条带不单一,使用自动化移液工作站通过SPRI Select磁珠完成纯化
  • 产物定量:DpnI消化产物,进行酶标仪定量
  • 重组反应:按照说明书要求,取0.03pmol质粒,使用自动化移液工作站配置重组反应体系,送入PCR仪进行重组反应
  • 热激转化:使用自动化移液工作站混合重组质粒和感受态细胞,在PCR仪内完成热激转化
  • 培养复苏:使用自动化移液工作站将转化体系加入到无抗性培养基中,线下摇床震荡培养
  • 涂板培养:复性的转化体系,使用自动化移液工作站进行涂板,或线下手动涂板
  • 平板培养:线下培养箱静置培养12小时以上
  • 单克隆挑取:使用克隆挑选系统挑取克隆或线下手动挑取
  • 扩大培养:使用线下摇床进行扩大培养
  • 单克隆验证:自动化移液工作站可配置菌液PCR体系或qPCR体系,线上PCR,或线下qPCR。或采取其他验证方式
  • 单克隆保存:自动化移液工作站可将验证结果良好的菌液从深孔板上挑出,进行扩大培养提质粒保存或菌液保存

代谢组学实验流程

  • 实验板准备:自动化移液工作站完成吸液1000ul甲醇和1000ul水(a板)进行配液
  • 样品板准备:自动化移液工作站吸液加500ul样本/质控/校准+20ul内标+500ul EUC-PH调节剂,送至震荡模块,室温1200rpm 1min
  • 调节PH:自动化移液工作站吸液加450-550ul EUC-PH调节剂2,调节PH到7,送至震荡模块,室温1200rpm 1min
  • 正压过滤:自动化移液工作站向柱板添加溶液,送至正压模块进行加压过滤柱板
  • 样品浓缩:洗脱的样品送至氮吹浓缩仪进行干燥
  • 样品复溶:使用自动化移液工作站添加40uL复溶,震荡器辅助震荡混合,送至离心机,4000rpm离心10分钟,取上清液进行检测
  • 质谱分析(线下):送至Echo-MS质谱进行分析

蛋白质组学实验流程

  • 实验板准备:自动化移液工作站吸取移取40uL/well预处理缓冲液至96深孔板
  • 样品板准备:自动化移液工作站将血清样本从1.5mL EP管转移出,加入96深孔板,送至震荡模块,室温30min
  • 还原:自动化移液工作站吸取移取5uL/well还原剂至96深孔板,送至震荡模块,室温30min
  • 烷基化:自动化移液工作站吸取烷基化试剂至96孔板混匀,室温避光反应30min(关灯)
  • 稀释:自动化移液工作站加入碳酸氢铵吸头吹打混匀
  • 蛋白酶解:使用自动化移液工作站移取新鲜配置的胰酶,加入深孔板每孔,吹打混合,送至孵育盒或培养箱37度震荡孵育过夜
  • 调节PH:自动化移液工作站加入TFA将pH调至2以下
  • 正压过滤:自动化移液工作站向柱板添加溶液,送至正压模块进行加压过滤柱板
  • 样品浓缩:洗脱的样品送至氮吹浓缩仪进行干燥
  • 样品复溶:使用自动化移液工作站添加40uL复溶,震荡器辅助震荡混合
  • 质谱分析(线下):送至Echo-MS质谱进行分析